Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc47a1Q8K0H1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc47a1Q8K0H1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc47a1Q8K0H1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc47a1Q8K0H1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc47a1Q8K0H1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms