Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lmbrd1Q8K0B2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmbrd1Q8K0B2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbrd1Q8K0B2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbrd1Q8K0B2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbrd1Q8K0B2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbrd1Q8K0B2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbrd1Q8K0B2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmbrd1Q8K0B2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmbrd1Q8K0B2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbrd1Q8K0B2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms