Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SltmQ8CH25 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SltmQ8CH25 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SltmQ8CH25 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SltmQ8CH25 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SltmQ8CH25 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SltmQ8CH25 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SltmQ8CH25 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SltmQ8CH25 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SltmQ8CH25 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SltmQ8CH25 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SltmQ8CH25 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SltmQ8CH25 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SltmQ8CH25 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SltmQ8CH25 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SltmQ8CH25 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms