Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdkl1Q8CEQ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl1Q8CEQ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms