Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
9030612E09RikQ8CE20 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
9030612E09RikQ8CE20 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
9030612E09RikQ8CE20 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
9030612E09RikQ8CE20 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms