Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35,99■■■■□ 3,35
Lrrc9Q8CDN9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,99■■■■□ 3,35
Lrrc9Q8CDN9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Lrrc9Q8CDN9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Lrrc9Q8CDN9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35,97■■■■□ 3,35
Lrrc9Q8CDN9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Lrrc9Q8CDN9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Lrrc9Q8CDN9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Lrrc9Q8CDN9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35,95■■■■□ 3,35
Lrrc9Q8CDN9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35,95■■■■□ 3,35
Lrrc9Q8CDN9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35,93■■■■□ 3,34
Lrrc9Q8CDN9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Lrrc9Q8CDN9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35,93■■■■□ 3,34
Lrrc9Q8CDN9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Lrrc9Q8CDN9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Lrrc9Q8CDN9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Lrrc9Q8CDN9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35,92■■■■□ 3,34
Lrrc9Q8CDN9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Lrrc9Q8CDN9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Lrrc9Q8CDN9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35,9■■■■□ 3,34
Lrrc9Q8CDN9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Lrrc9Q8CDN9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC35,87■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35,86■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35,86■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Lrrc9Q8CDN9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,82■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35,81■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC35,8■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35,78■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,77■■■■□ 3,32
Lrrc9Q8CDN9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35,76■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC35,7■■■■□ 3,31
Lrrc9Q8CDN9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35,69■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35,67■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35,66■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35,65■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,3
Lrrc9Q8CDN9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,61■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,61■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35,6■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35,58■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,29
Lrrc9Q8CDN9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Lrrc9Q8CDN9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Lrrc9Q8CDN9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Lrrc9Q8CDN9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Lrrc9Q8CDN9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Lrrc9Q8CDN9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35,55■■■■□ 3,28
Lrrc9Q8CDN9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Lrrc9Q8CDN9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35,55■■■■□ 3,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms