Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynpoQ8CC35 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynpoQ8CC35 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynpoQ8CC35 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynpoQ8CC35 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynpoQ8CC35 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynpoQ8CC35 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynpoQ8CC35 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SynpoQ8CC35 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SynpoQ8CC35 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SynpoQ8CC35 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SynpoQ8CC35 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SynpoQ8CC35 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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