Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samd4aQ8CBY1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samd4aQ8CBY1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Samd4aQ8CBY1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Samd4aQ8CBY1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms