Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Lrrn3Q8CBC6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrn3Q8CBC6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrn3Q8CBC6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrn3Q8CBC6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms