Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ppfibp1Q8C8U0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ppfibp1Q8C8U0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ppfibp1Q8C8U0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfibp1Q8C8U0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppfibp1Q8C8U0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms