Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Alx1Q8C8B0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Alx1Q8C8B0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Alx1Q8C8B0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Alx1Q8C8B0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Alx1Q8C8B0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Alx1Q8C8B0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Alx1Q8C8B0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Alx1Q8C8B0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Alx1Q8C8B0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Alx1Q8C8B0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Alx1Q8C8B0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Alx1Q8C8B0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Alx1Q8C8B0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Alx1Q8C8B0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Alx1Q8C8B0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Alx1Q8C8B0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Alx1Q8C8B0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Alx1Q8C8B0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1530.7 ms