Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sfrp1Q8C4U3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sfrp1Q8C4U3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sfrp1Q8C4U3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sfrp1Q8C4U3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms