Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc44a2Q8BY89 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc44a2Q8BY89 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc44a2Q8BY89 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms