Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ6

UPF0505 protein C16orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BWQ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BWQ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8BWQ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8BWQ6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q8BWQ6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms