Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dclk3Q8BWQ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclk3Q8BWQ5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dclk3Q8BWQ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dclk3Q8BWQ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms