Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TtpaQ8BWP5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TtpaQ8BWP5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TtpaQ8BWP5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TtpaQ8BWP5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TtpaQ8BWP5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TtpaQ8BWP5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TtpaQ8BWP5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TtpaQ8BWP5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TtpaQ8BWP5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TtpaQ8BWP5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TtpaQ8BWP5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms