Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp398Q8BV16 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfp398Q8BV16 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp398Q8BV16 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zfp398Q8BV16 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms