Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pggt1bQ8BUY9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pggt1bQ8BUY9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pggt1bQ8BUY9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms