Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUJ9

Lrp12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp12Q8BUJ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrp12Q8BUJ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrp12Q8BUJ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp12Q8BUJ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp12Q8BUJ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms