Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,79
Ap3s2Q8BSZ2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19,94■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,9■□□□□ 0,78
Ap3s2Q8BSZ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,89■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19,86■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,85■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,84■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Ap3s2Q8BSZ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,82■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,82■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,81■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,81■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,81■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19,81■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19,8■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19,79■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19,79■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19,78■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Ap3s2Q8BSZ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,78■□□□□ 0,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47,9 ms