Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ppfia2Q8BSS9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ppfia2Q8BSS9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Ppfia2Q8BSS9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Ppfia2Q8BSS9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Ppfia2Q8BSS9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Ppfia2Q8BSS9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23,78■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ppfia2Q8BSS9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23,75■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23,72■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Ppfia2Q8BSS9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23,67■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23,65■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Ppfia2Q8BSS9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ppfia2Q8BSS9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,9 ms