Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJW7

Eme1, Crossover junction endonuclease EME1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme1Q8BJW7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme1Q8BJW7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme1Q8BJW7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eme1Q8BJW7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eme1Q8BJW7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eme1Q8BJW7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eme1Q8BJW7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eme1Q8BJW7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eme1Q8BJW7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eme1Q8BJW7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eme1Q8BJW7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eme1Q8BJW7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eme1Q8BJW7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eme1Q8BJW7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms