Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
D130040H23RikQ8BII3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
D130040H23RikQ8BII3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
D130040H23RikQ8BII3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
D130040H23RikQ8BII3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms