Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmd4aQ8BIE6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Frmd4aQ8BIE6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Frmd4aQ8BIE6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmd4aQ8BIE6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms