Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc40Q8BI79 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc40Q8BI79 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc40Q8BI79 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc40Q8BI79 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc40Q8BI79 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc40Q8BI79 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc40Q8BI79 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc40Q8BI79 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc40Q8BI79 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms