Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dusp4Q8BFV3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dusp4Q8BFV3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dusp4Q8BFV3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dusp4Q8BFV3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dusp4Q8BFV3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dusp4Q8BFV3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dusp4Q8BFV3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dusp4Q8BFV3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dusp4Q8BFV3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dusp4Q8BFV3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dusp4Q8BFV3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dusp4Q8BFV3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dusp4Q8BFV3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dusp4Q8BFV3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dusp4Q8BFV3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dusp4Q8BFV3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dusp4Q8BFV3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dusp4Q8BFV3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dusp4Q8BFV3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dusp4Q8BFV3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dusp4Q8BFV3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dusp4Q8BFV3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms