Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc181Q80ZU5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc181Q80ZU5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc181Q80ZU5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc181Q80ZU5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc181Q80ZU5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc181Q80ZU5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc181Q80ZU5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc181Q80ZU5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc181Q80ZU5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms