Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmcc2Q80W04 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmcc2Q80W04 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc2Q80W04 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc2Q80W04 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc2Q80W04 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc2Q80W04 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc2Q80W04 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc2Q80W04 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmcc2Q80W04 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmcc2Q80W04 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmcc2Q80W04 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmcc2Q80W04 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmcc2Q80W04 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmcc2Q80W04 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms