Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WhrnQ80VW5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WhrnQ80VW5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WhrnQ80VW5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WhrnQ80VW5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WhrnQ80VW5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WhrnQ80VW5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WhrnQ80VW5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WhrnQ80VW5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WhrnQ80VW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms