Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aldh3b1Q80VQ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh3b1Q80VQ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Aldh3b1Q80VQ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Aldh3b1Q80VQ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aldh3b1Q80VQ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms