Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Actr5Q80US4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actr5Q80US4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actr5Q80US4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actr5Q80US4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actr5Q80US4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actr5Q80US4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actr5Q80US4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actr5Q80US4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actr5Q80US4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Actr5Q80US4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actr5Q80US4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actr5Q80US4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actr5Q80US4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms