Protein–RNA interactions for Protein: Q80TS7

Ddn, Dendrin, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DdnQ80TS7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DdnQ80TS7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DdnQ80TS7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DdnQ80TS7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DdnQ80TS7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DdnQ80TS7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DdnQ80TS7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DdnQ80TS7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DdnQ80TS7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DdnQ80TS7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DdnQ80TS7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms