Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnf1Q7TSH7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnf1Q7TSH7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnf1Q7TSH7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnf1Q7TSH7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnf1Q7TSH7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnf1Q7TSH7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnf1Q7TSH7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnf1Q7TSH7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnf1Q7TSH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kcnf1Q7TSH7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnf1Q7TSH7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.9 ms