Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ShprhQ7TPQ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ShprhQ7TPQ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ShprhQ7TPQ3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ShprhQ7TPQ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ShprhQ7TPQ3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ShprhQ7TPQ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ShprhQ7TPQ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ShprhQ7TPQ3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ShprhQ7TPQ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ShprhQ7TPQ3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ShprhQ7TPQ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ShprhQ7TPQ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ShprhQ7TPQ3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ShprhQ7TPQ3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ShprhQ7TPQ3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ShprhQ7TPQ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms