Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNP2

Ppp2r1b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A beta isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r1bQ7TNP2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp2r1bQ7TNP2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp2r1bQ7TNP2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp2r1bQ7TNP2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms