Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcg2Q7TMS5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcg2Q7TMS5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcg2Q7TMS5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcg2Q7TMS5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg2Q7TMS5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms