Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMA4

Ffar4, Free fatty acid receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ffar4Q7TMA4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ffar4Q7TMA4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ffar4Q7TMA4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ffar4Q7TMA4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ffar4Q7TMA4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ffar4Q7TMA4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ffar4Q7TMA4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ffar4Q7TMA4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ffar4Q7TMA4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ffar4Q7TMA4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ffar4Q7TMA4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ffar4Q7TMA4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ffar4Q7TMA4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ffar4Q7TMA4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ffar4Q7TMA4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ffar4Q7TMA4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ffar4Q7TMA4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ffar4Q7TMA4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms