Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcl2Q78Y63 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcl2Q78Y63 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcl2Q78Y63 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl2Q78Y63 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcl2Q78Y63 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms