Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LcorQ6ZPI3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LcorQ6ZPI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LcorQ6ZPI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LcorQ6ZPI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms