Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc9c1Q6UJY2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc9c1Q6UJY2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc9c1Q6UJY2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc9c1Q6UJY2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc9c1Q6UJY2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc9c1Q6UJY2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc9c1Q6UJY2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc9c1Q6UJY2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc9c1Q6UJY2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc9c1Q6UJY2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc9c1Q6UJY2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc9c1Q6UJY2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc9c1Q6UJY2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc9c1Q6UJY2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc9c1Q6UJY2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc9c1Q6UJY2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc9c1Q6UJY2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc9c1Q6UJY2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc9c1Q6UJY2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc9c1Q6UJY2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc9c1Q6UJY2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc9c1Q6UJY2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms