Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tlr13Q6R5N8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tlr13Q6R5N8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr13Q6R5N8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tlr13Q6R5N8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlr13Q6R5N8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms