Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfsd13aQ6PDE8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms