Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl3Q6P1Y1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl3Q6P1Y1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl3Q6P1Y1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rtl3Q6P1Y1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtl3Q6P1Y1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl3Q6P1Y1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl3Q6P1Y1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl3Q6P1Y1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms