Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc189Q6NZQ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc189Q6NZQ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms