Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParpbpQ6IRT3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ParpbpQ6IRT3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ParpbpQ6IRT3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ParpbpQ6IRT3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms