Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Surf4Q64310 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Surf4Q64310 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Surf4Q64310 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Surf4Q64310 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms