Protein–RNA interactions for Protein: Q64264

Htr1a, 5-hydroxytryptamine receptor 1A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1aQ64264 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Htr1aQ64264 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Htr1aQ64264 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Htr1aQ64264 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Htr1aQ64264 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Htr1aQ64264 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Htr1aQ64264 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr1aQ64264 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr1aQ64264 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr1aQ64264 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr1aQ64264 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr1aQ64264 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Htr1aQ64264 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Htr1aQ64264 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr1aQ64264 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htr1aQ64264 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htr1aQ64264 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms