Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zic2Q62520 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zic2Q62520 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zic2Q62520 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zic2Q62520 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms