Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Vil1Q62468 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Vil1Q62468 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vil1Q62468 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vil1Q62468 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Vil1Q62468 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms