Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sprr1bQ62267 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sprr1bQ62267 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms